PPK kepanjangan dari Penguatan Pendidikan Karakter merupakan salah satu program sekolah yang mengutamakan guru untuk menanamkan pendidikan Karakter kepada siswa. Tujuan penanaman karakter ini adalah untuk melaksanakan penguatan pendidikan karekter disekolah sehingga siswa memiliki kepedulian, karamahan, welas asih, dan cinta lingkungan. Di SMP Negeri 3 Banguntapan dalam penerapan PPK dilakungan dengan 3 tiga basis yaitu, basis kelas, basis masyarakat, dan basis budaya.
Basis Kelas dilakukan dengan integritas nilai karakter dalam pembelajaran, guru mengajak siswa untuk Tepuk PPK, Salam PPK, dan menyanyikan Mars PPK di sela-sela pembelajaran yang dapat digunakan sebagai reflesing diri dalam pembelajaran. Basis Mayarakat yaitu dengan menjalin kerjasama dengan masyarakat sekitar, Koramil, Kepolisisan, Pondok Pesantren, Pedukuhan, PTN, Puskesmas, DUDI, dan mengadakan Pengajian dengan POT (Perwakilan Orang Tua). Sedangkan berbasis budaya yaitu dengan mengadakan pembiasaan, keteladanan, dan pemberdayaan.
Dengan adanya program PPK di SMP Negeri 3 Banguntapan ini diharapkan seluruh guru, karyawan dan siswa dapat menerapkan karakter yang baik guna menjadi contoh di lingkungan masyarakat bahwa menanamkan pendidikan karakter yang baik itu penting untuk meningkatkan karakter pemuda/I bangsa Indonesia menjadi labih baik dan memiliki budi pekerti yang mulia.